وظیفه این بخش توسعه زیر ساختهای نرم افزاری در همه بخشهای وزارتخانه، مکانیزه کردن خدمات وزارتخانه و تامین تمامی نیازمندیهای نرم افزاری بخشها و واحدهای مختلف وزارتخانه است. علی رغم مشکلات متعددی که در حوزه نرم افزار در همه دستگاههای دولتی وجود دارد، این واحد در طی سالهای 1386 و 1387 با طراحی، پیاده سازی و استقرار بیش از 20 نرم افزار کاربردی و بانک اطلاعاتی جهت استفاده بخشهای مختلف وزارتخانه بخش کوچکی از وظایف خود در این حوزه را انجام داده است.